質(zhì)譜法基因分型技術(shù)簡介

DNA質(zhì)譜陣列基因分析系統(tǒng)以其通量高、自動(dòng)化、靈活、結(jié)果準(zhǔn)確、實(shí)驗(yàn)成本低廉等諸多優(yōu)勢成為了大學(xué)、醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所、生物技術(shù)公司、制藥企業(yè)、疾控中心等機(jī)構(gòu)所推崇的研究工具。應(yīng)用領(lǐng)域涵蓋醫(yī)學(xué)及轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)、分子生物學(xué)、基因組學(xué)、表觀遺傳學(xué)、農(nóng)業(yè)遺傳育種及轉(zhuǎn)基因技術(shù)等相關(guān)領(lǐng)域。

檢測儀器信息

Sequenom MassArray時(shí)間飛行質(zhì)譜生物芯片系統(tǒng)是為基因組學(xué)研究提供兼顧靈敏度和特異服務(wù)的中高通量技術(shù)平臺(tái)，廣泛地應(yīng)用于遺傳突變檢測、SNP分型以及DNA甲基化定量分析研究，是目前唯yi采用質(zhì)譜法進(jìn)行直接檢測的設(shè)備。

Sequenom MassArray系統(tǒng)反應(yīng)體系為非雜交依賴性，不需要各種標(biāo)記物，實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)靈活，更可實(shí)現(xiàn)高達(dá)40重反應(yīng)，是目前市場上擁有高性價(jià)比的產(chǎn)品。

Sequenom MassArray特定SNP位點(diǎn)檢測服務(wù)采用專業(yè)的引物設(shè)計(jì)和基因分型軟件，可對(duì)95%以上已被證實(shí)的SNP進(jìn)行實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)，特別適合于SNP位點(diǎn)小于200個(gè)，樣本量大于500份的項(xiàng)目。實(shí)驗(yàn)過程無需熒光標(biāo)記，大大降低每次基因型分析的成本。

檢測原理
Sequenom MassARRAY® 分子量陣列技術(shù)是Sequenom 公司推出的世界上的基因分析工具，通過引物延伸或切割反應(yīng)與靈敏、可靠的MALDI-TOF質(zhì)譜技術(shù)相結(jié)合，經(jīng)過PCR擴(kuò)增,SAP酶處理, 延伸引物單堿基延伸,樹脂除鹽純化, 芯片點(diǎn)樣, 質(zhì)譜檢測等實(shí)驗(yàn)步驟，終使用Typer4.0 軟件分析實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，獲得基因分型結(jié)果。 
具體原理：Sequenom MassArray系統(tǒng)主要是利用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜 (MALDI-TOF MS) 進(jìn)行分析，即PCR擴(kuò)增產(chǎn)物或者預(yù)處理樣本在延伸單堿基后，將制備的樣品分析物與芯片基質(zhì)共結(jié)晶，將該晶體放入質(zhì)譜儀的真空管，而后用瞬時(shí)納秒 (10-9s) 強(qiáng)激光激發(fā)，由于基質(zhì)分子經(jīng)輻射所吸收的能量，導(dǎo)致能量蓄積并迅速產(chǎn)熱，從而使基質(zhì)晶體升華，核酸分子就會(huì)解吸附并轉(zhuǎn)變?yōu)閬喎€(wěn)態(tài)離子，產(chǎn)生的離子多為單電荷離子，這些單電荷      離子在加速電場中獲得相同的動(dòng)能，進(jìn)而在一非電場漂移區(qū)內(nèi)按照其質(zhì)荷比率得以分離，在真空小管中飛行到達(dá)檢測器。 
檢測應(yīng)用 
中高通量SNP基因型分析
GWAS及二代測序驗(yàn)證
腫瘤體細(xì)胞基因突變譜分析
基因表達(dá)定量及目標(biāo)基因CNV分析
DNA甲基化定位定量
病原體分子分型
技術(shù)優(yōu)勢
定制靈活：可以自由選擇感興趣的SNP位點(diǎn)一張芯片上，樣本的數(shù)量和位置可以自由選擇一張芯片上，樣本和SNP位點(diǎn)的配對(duì)可以自由選擇。
分析準(zhǔn)確：直接檢測待測物分子量，準(zhǔn)確度超過99.7%。質(zhì)譜技術(shù)靈活檢測PCR實(shí)驗(yàn)失敗或三等位基因的存在?？芍貜?fù)性高，每個(gè)樣品將要檢測到SNP位點(diǎn)適合精細(xì)定位和芯片實(shí)驗(yàn)的后續(xù)研究。
高通量檢測：一張芯片上可完成384個(gè)樣品的多重iPLEX GOLD實(shí)驗(yàn)；每個(gè)反應(yīng)孔高可實(shí)現(xiàn)多達(dá)40重反應(yīng)；每天可進(jìn)行高達(dá)十萬次基因型分析。
檢測服務(wù)流程
1、客戶提供DNA或者生物樣本，并需要檢測SNP位點(diǎn)(rs編號(hào)) 
2、設(shè)計(jì)引物(包括PCR擴(kuò)增引物和單堿基延伸引物) 
3、樣本制備PCR擴(kuò)增、SAP處理、單堿基延伸 
4、點(diǎn)樣制備檢測用芯片陣列 
5、MALDI-TOF質(zhì)譜檢測 
6、數(shù)據(jù)分析、給出分型報(bào)告 

樣本要求 
基因組DNA: 總量大于10 ng（視檢測位點(diǎn)數(shù)量遞增） 
A260/280在1.8-2.0 
A260/230大于1.8 
服務(wù)流程 
1、提交項(xiàng)目課題相關(guān)需求和資料。 
2、與我們的專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)討論項(xiàng)目細(xì)節(jié)。 
3、根據(jù)討論后的意見對(duì)實(shí)驗(yàn)方案進(jìn)行修改。 
4、雙方均滿意并達(dá)成一致，簽訂技術(shù)服務(wù)合同。 
5、開展實(shí)驗(yàn)，按期完成合同規(guī)定的內(nèi)容。 
6、結(jié)題，提供實(shí)驗(yàn)原始結(jié)果和分析結(jié)果、實(shí)驗(yàn)流程、實(shí)驗(yàn)條件等等。 
咨詢與訂購 
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